brmlab

User Tools

Site Tools

You are here: Hackerspace Prague » Projects » BrmHistology
project:brmhistology:start

Differences

This shows you the differences between two versions of the page.

Link to this comparison view

Both sides previous revisionPrevious revision
Next revision		Previous revision
project:brmhistology:start [2018/11/13 18:11] – sumie-dhproject:brmhistology:start [2025/03/22 13:57] (current) – [BrmHistology] sumie-dh
Line 10: Line 10:
  
 ~~META: ~~META:
-status = active+status = pseudo-archieved 
 &relation firstimage = :project:nahled.jpg &relation firstimage = :project:nahled.jpg
 ~~ ~~
- +Disclaimer: dneska [status k 21.03.2025] ma intel a prakticky level rutinniho pouziti sumie-dh [od fieldworku po finalni produkt a kuratorstvi sbirek] . V brmlabu uz vetsina techniky nestoji, chcete-li si tohle znova najet napiste maila sumie-dh. Poradny mikrotom uz neni, stoji v jinem labu, je pouze ten rucni mikrotom co je videt nize. Taktez veskery glassware se musi dokoupit. Inkubator jest. Hotplate pro chronologicke razeni rezu rovnou na sklo neni, pouze vodni lazen v topnem hnizde se da zaridit. Destilacni kolona pro cisteni provozni chemie jest.  Histobarvicek je nepreberne ale do zacatku se to nedoporucuje michat 'doma', pokud se ucite, kupujte veci co funguji uz v hotovem roztoku. Provozni cajky jako montovaci media, skla, Paraplasty, clearing/dehydration/fixation agents si resi kazdy sam vlastnim rozpoctem [mozno diskutovat pusteni nejakych korunek na vetsi projekt s peknym zacilenim na konkretni vysledek].  U vetsich veci s konkretnim cilenim poslete protokol, uvidi se jestli je alespon cast z toho na sklade. Ale bez poradneho mikrotomu od toho moc necekejte, tohle neni zrovna DIY-friendly task [mistni team uz si tohouhle fazi prosel a dava na vedomi ze DIY trapeni v histologii se skutecne nevyplati - ztraceny cas]. Dobry kus startuje nekde kolem 13-15 kKc. 
-Uz pres rok rezeme zivocichy [mrtve, zivi se prilis hemzi] na platky a menime prirozene bezbarve tkane na 50 odstinu fialove/ruzove ;]+
  
 ==== Technika ==== ==== Technika ====
  
 ===Mikrotomy=== ===Mikrotomy===
- 
-== Mikrotom sankovy== 
- 
-{{http://www.sumie-dh.cz/images/gallery/mikrotom2.jpg?direct&400}} 
- 
-**>>Aktualne v depozitu - nutno vyzadat<<** 
- 
-owner: [[:user:sumie-dh|sumie-dh]] 
- 
-Pro presnejsi histologickou praci stoji na mikroskopovacim stole mikrotom Meopta 596 C8. Je to poradny kus kovu, prosime nepresouvat ;] Nuz je k dispozici na vyzadani pote co bude zajemce obeznamen s funkci pristroje, bez toho je velice snadne se nozem zranit nebo ho znicit [popripade oboji].  
-Mikrotom je vhodny pro rezani tkani zalitych do parafinu, tloustka rezu je nastavitelna do 3 um. 
- 
-PS: tento pristroj neni hackable, je to jedna z tech veci kterou nelze prilis obejit DIY projektem, je potreba poctivy kus tezkeho zeleza ;] 
- 
-PPS: pokud uz mate opravdovy mikrotom, lze s nim provadet drobnejsi hacky, napr. pokud je potreba prichladit vzorek [parafin se krouti, lame v teple mistnosti], hodi se Peltieruv clanek 
- 
-{{http://www.sumie-dh.cz/images/gallery/peltiersedi.jpg?direct&400}} 
- 
  
 == Mikrotom [rucni] == == Mikrotom [rucni] ==
Line 46: Line 27:
 Pocitejte s tim ze u tohoto mikrotomu nedosahnete kvality kterou vetsina skutecne histologicke prace vyzaduje, vzdy dostanete vzorek na nemz bude videt nekolik vrstev bunek, pri barveni budete videt "orvane" okraje tkani, ktere se barvi ochotneji nez u spravne rozvnomerne provedeneho rezu.  Pocitejte s tim ze u tohoto mikrotomu nedosahnete kvality kterou vetsina skutecne histologicke prace vyzaduje, vzdy dostanete vzorek na nemz bude videt nekolik vrstev bunek, pri barveni budete videt "orvane" okraje tkani, ktere se barvi ochotneji nez u spravne rozvnomerne provedeneho rezu. 
 Je ale dostacujici na nektera pozorovani rostlinnych pletiv a tkani, ktere maji transparentnejsi charakter [napr. tuk nebo chrupavky]. K mikrotomu patri mikrotomovaci nuz [je mozno nahradit ziletkami, pokud zjistite ze je nuz tupy a nemate odvahu jej brousit].  Je ale dostacujici na nektera pozorovani rostlinnych pletiv a tkani, ktere maji transparentnejsi charakter [napr. tuk nebo chrupavky]. K mikrotomu patri mikrotomovaci nuz [je mozno nahradit ziletkami, pokud zjistite ze je nuz tupy a nemate odvahu jej brousit]. 
- 
-Princip prace s mikrotomem je videt nize na videu [popripade si chytte [[:user:sumie-dh|sumie-dh]], ukaze vam to pokud si nejste jisti]. 
- 
-{{youtube>uB-acKfWlV4?medium}} 
  
 \\ \\
Line 57: Line 34:
  
 ...maji vlastni [[equipment:brmicroscopy|wiki]] ;] ...maji vlastni [[equipment:brmicroscopy|wiki]] ;]
- 
-=== Histologicke barvicky === 
- 
-Jsou. Aktualne se ceka na rebuilding chemlabu.  
- 
-=== Drobne 3D modely === 
- 
-Nektere veci mame jiz namodelovane pro 3D tisk, vyhneme se tak efektu 'lze koupit pouze v baleni po 500ks'. Zalevaci komurky je vhodne tisknout z tepelne odolnejsiho plastu, napr PET. Vetsina plastu 
-pouzivanych v 3D tisku se nekamaradi s prosvetlovacimi rozpoustedly [benzen, toluen, xylen]. 
- 
-Zalevaci komurky [base molds] 
- 
-[[http://www.sumie-dh.cz/data/files/dock.stl|mrnave vzorky]]\\ 
-[[http://www.sumie-dh.cz/data/files/38-29-10.stl|male vzorky]]\\ 
-[[http://www.sumie-dh.cz/data/files/jicen.stl|stredni vzorky]]\\ 
-[[http://www.sumie-dh.cz/data/files/jicen-vetsi.stl|velke vzorky]]\\ 
- 
-Histologicke kazety [male] 
- 
-[[http://www.sumie-dh.cz/data/files/cassete-v2.stl|vrsek]]\\ 
-[[http://www.sumie-dh.cz/data/files/cassete-spodek3.stl|spodek]]\\ 
- 
-Kosticky do mikrotomove svorky > dobre nam funguji [[https://www.thingiverse.com/thing:955078|LEGO kostky]] ;]\\ 
-Nastavitelne boxiky na [[https://www.thingiverse.com/thing:1416590|zamontovane vzorky]] 
- 
-==== Barvici protokoly ==== 
- 
-Z hovoru s odborniky s praxi z oboru vyplynulo ze internet neni prilis dobrym zdrojem  spolehlivych protokolu. 
-Proto postupy prebirame ze skripta Histologie a histologická technika II od Zdenka Vacka. Oba dily velmi pravdepodobne najdete v biolabi knihovne. 
- 
-V biolabu se pouziva odvodnovani alkoholovou radou, prosvetlovani toluenem a zalevani do parafinu [Paraplast s ruznou teplotou tani]. Mame DYI verzi vodni lazne pro parafinovani a termostat pro  
-natahovani parafinovych rezu na sklicko. 
-  
-Vyzkouseli jsme a fungovalo: 
- 
-Eosin-Hematoxylin\\ 
-Nisslovo barveni\\ 
-Grammovo barveni\\ 
-Bielschowskeho protokol [nervove fibrily]\\ 
-Fuchsin [barveni rostlinnych pletiv]\\ 
- 
  
 ==== Vysledky ==== ==== Vysledky ====
  
-Mame v supliku nekolik vzorku v koukatelne kvalite.\\ +Co jsme delali mezi 2020-2022 & non-project samples [[http://brmlab.s0c4.net/histolka|Leaflet WSI]].
-**TODO** - dodelat do map klikatelne popisky +
- +
-Vetsi povedenejsi preparaty jsou prevedeny do 'mapove' podoby pomoci [[http://brmlab.s0c4.net/histolka|Leaflet]]. Slozeno z vetsiho poctu framu zvetsenych 125x. +
- +
-[[http://brmlab.s0c4.net/histolka|**Rozcestnik**]]\\ +
- +
-Ostatni vzorky jsou dostupne pouze jako obrazky:+
  
-__Savci__  
  
-[[http://www.sumie-dh.cz/images/gallery/uzlina.jpg|Mizni uzlina - [Tur domaci]]] \\+Jaka uroven se dela recentne [2022-2025] [[https://bioosm.brmlab.cz/histolka/project_imagery/project_imagery.htm|**Projektove WSI @ sumie-dh**]]\\
  
-__Ryby__ 
  
-[[http://www.sumie-dh.cz/images/gallery/pyloric-region.jpg|Zaludek [Tetra paraquayska - Moenkhausia sanctaefilomenae]]]\\ 
-Strevo  [Tetra paraguayska - Moenkhausia sanctaefilomenae]\\ 
-[[http://www.sumie-dh.cz/images/gallery/vajca21.jpg|Vajecnik [Tetra paraguayska - Moenkhausia sanctaefilomenae]]]\\ 
-Rez koronarni [Zivorodka endlerova - Poecilia wingei ♀]\\ 
    
  
project/brmhistology/start.1542132675.txt.gz · Last modified: 2018/11/13 18:11 by sumie-dh